Diskuse:Adenosintrifosfát

WikiProjekt Chemie

obor: Biochemie

Kvalita:  dobrý článek

Tento článek již dosáhl úrovně dobrých článků. Stále však nesplňuje kritéria pro nejlepší články. Můžete WikiProjektu Chemie pomoci tím, že tento článek rozšíříte a posunete ve stupnici výše.

Z hesla Adenosintrifosfát byla v období od 14. do 20. února 2011 uvedena na hlavní straně následující zajímavost:

„Víte, že … svaly maratonského běžce Channučiho za přibližně dvě hodiny běhu rozložily asi 60 kg adenosintrifosfátu, tedy více než on sám vážil?“

Článek týdne

Tento článek byl v 4. týdnu 2016 uveden na hlavní straně jako článek týdne.

a) Korektní název podle české verze názvosloví IUPAC, které je závazné pro organickou chemii a biochemii je u této sloučeniny se "s", tedy adenosintrifosfát (přesněji Adenosin-5'-trifosfát). Bude třeba přesun. Prosím Reo On o vyjádření, nechci to dělat "přes něho"

b) Domnívám se, že odkaz na tenisty je tady trochu nadbytečný, že by se z rediru z ATP měla udělat výhybka, vedoucí na oba významy zkratky. Podle mého názorvu by to bylo čstší, ale nachám to na původním autorovi.

--A.Vítek 20:13, 24. 7. 2005 (UTC)

Dík za vyjádření a za ověřování názvosloví.

a) Já už jsem si dávno uvědomil, že tenhle název není korektně. Ale do přesunu se mi nechtělo (vlastně sem zatím žádnej ještě nedělal). Nejrozumější by byla stránka s jednoslovným názvem Adenosintrifosfát a vymezením chemického názvu v textu.

b) Bylo by to čistší, ale technicky vzato. Přeci jen, ať už je základní název jakýkoliv, maximální míru používání má jeho zkratka. Ten kdo by jí hledal, ať už z vnějšku, ale hlavně skrze odkazy, by mohl být zbytečně zaskočen. zz mnoha textů, ve kterých se zkratka ATP zcela automaticky používá, nemusí nezaangažovaní vůbec ani rámcově pochopit o co jde. Zbytečně, když druhý význam je u nás poněkud marginální. Asi bych to alespoň prozatím nechal tak (alespoň do doby než někdo napíše článek na tenisový ATP). Ale neznamená to, že na tom trvám.

--Reo On 20:36, 24. 7. 2005 (UTC)

Koukám na en a tam skutečně ATP vede na adenozin, ale v záhlaví je odkaz na rozcestník ATP. --Li-sung ✉ 20:39, 24. 7. 2005 (UTC)

Jednoduchá řešení bývají ta nejlepší. Dík, vypadá líp. --Reo On 20:51, 24. 7. 2005 (UTC)

Bude se dělat ten přesun na adenosintrifosfát? Přiznám se, že mě adenozin trifosfát trošku zaskočil a popravdě jsem se s ním ještě nikdy nesetkal. --Ragimiri 20:51, 13. 10. 2006 (UTC)

Kinasy přenáší adenosyl?

V článku je uvedeno: "Většina kináz rozkládá ATP na ADP a Pi, lze však přenášet i difosfát (za současného vzniku AMP) a výjimečně adenosylový zbytek za současného uvolnění difosfátu a monofosfátu do prostředí.[10]" (zdroj je Vodrážka, kterýho nemám) Podle mě kinasy z definice přenáší fosfát (nebyl bych si jist ani tím pyrofosfátem). Adenosyl je možné přenášet, ale to dělají jiné enzymy, které se nejmenují kinasy.
Mimochodem, všimněte si, že je v jedné větě použito kináza a adenosyl. Pěkný názvoslovný svinčík.
HlTo CZ (diskuse) 19. 6. 2020, 13:59 (CEST)

Názvosloví vypadá zcela v pořádku, co se týče kináz, našel jsem vícero zdrojů uvádějících, že přenáší i difosfát. Najděte zdroj, který vyvrací tvrzení p. Vodrážky a ve článku pak můžete popsat, že existují dvě odlišné teorie. --Dvorapa (diskuse) 19. 6. 2020, 14:13 (CEST)

Jak můžete říct, že názvosloví vypadá v pořádku, když mícháte hrušky s jablkama?

Jak jsem psal, tím difosfátem si nejsem jist (a jak jsem psal, nemám Vodrážku a tedy nevím, co konkrétně je tam napsáno; dokážu si představit, že je tam zmíněno, že kinasy přenáší fosfát a kromě toho je přenášen i difosfát, nebo adenosyl a někdo si to přeložil, že všechny tři skupiny přenáší kinasy), ale rozhodně pochybuju o tom adenosylu. HlTo CZ (diskuse) 19. 6. 2020, 14:25 (CEST)

Co se ještě týče pana Vodrážky, zřejmě se bude jednat o významného a pravděpodobně již zesnulého profesora VŠCHT. --Dvorapa (diskuse) 19. 6. 2020, 14:34 (CEST)

Anebo kniha Enzymologie (i když to budou možná spíš skripta) skrývající se pod číslem 10, nikoli na Downing Street? HlTo CZ (diskuse) 19. 6. 2020, 14:37 (CEST)

Jasně, ideálně navštívit místní vědeckou knihovnu a obě monografie si prolistovat a na základě nich poté opravit chyby, do té doby můžeme maximálně zachovat status quo, pokud nenajdeme jiný vhodný zdroj. Anglická Wikipedie uvádí stejnou informaci, doplňuje zdroj týkající se NDP kinase. --Dvorapa (diskuse) 19. 6. 2020, 14:46 (CEST)

Kde? Já jsem našel akorát "ATP can also be synthesized through several so-called "replenishment" reactions catalyzed by the enzyme families of nucleoside diphosphate kinases (NDKs), which use other nucleoside triphosphates as a high-energy phosphate donor, and the ATP:guanido-phosphotransferase family.", což neříká nic o přenosu adenosylové skupiny. HlTo CZ (diskuse) 19. 6. 2020, 15:15 (CEST)

Obě Vodrážkovy knihy mám doma. Vodrážka uvádí v sekci Kofaktory, podsekci Adenosintrifosfát: "Adenosintrifosfát je kofaktorem skupiny transferas označovaných triviálním názvem kinasy. Přenáší, za odštěpení ADP, fosforylovou skupinu -PO3^2- na hydroxylové skupiny alkoholů, na acyly nebo na skupiny guanidylové. Méně časté jsou přenosy difosfátového zbytku za uvolnění AMP, přenos adenosinmonofosfátového zbytku za odštěpení difosfátu nebo výjimečně adenosylového zbytku za uvolnění monofosfátu a difosfátu". Nejsem úplně biochemik, takže nevím; ale podobně jako @HlTo CZ: znám jen kinázy přenášející fosfát. Je možné, že Vodrážka skutečně kinázy definuje jen jako přenášející fosfát, a věta "Méně časté" se už kináz netýká a jen jsem to špatně pochopil, když jsem článek psal. --Vojtěch Dostál (diskuse) 20. 6. 2020, 10:06 (CEST)

Výborně! Ano, adenosyltransferasy patří do EC 2.5.1, kdežto kinasy jsou EC 2.7. Enzymy přenášející difosfát patří do EC 2.7.6 a nazývají se difosfokinasami, tak otázka, jestli to lze zahrnout pod kinasy. Ale určitě ne adenosyltransferasy. HlTo CZ (diskuse) 20. 6. 2020, 11:54 (CEST)

@HlTo CZ Navrhl jsem úpravu, klidně ještě koriguj či doplň dle té výše uvedené citace ;). --Vojtěch Dostál (diskuse) 20. 6. 2020, 13:44 (CEST)